应用程序是为完成某项或多项特定工作的计算机程序，它运行在用户模式，可以和用户进行交互，具有可视的用户界面，通常把这类文件称为可执行文件（扩展名为.exe）。
在Windows 7中，“开始”按钮可以管理程序，把各种类型的“快捷方式”分门别类地存放在“开始”菜单“所有程序”项目中的不同文件夹内。
在Windows 7中，启动应用程序有多种方法，如单击“开始”按钮，选择“所有程序”选项，在“所有程序”中找到应用程序并单击其名称即可启动应用程序；或者在资源管理器或计算机窗口中，找到需要启动的应用程序的执行文件，双击文件名称也可以启动应用程序；若在桌面上有应用程序的快捷方式图标，也可以双击桌面上的相应快捷方式快速启动应用程序。
退出应用程序常见的方法是单击应用程序窗口右上角的“关闭”按钮，也可以选择应用程序“文件”菜单中的“退出”选项，或者按Alt+F4键也可退出当前应用程序。
Windows可以同时运行多个应用程序，每打开一个应用程序，任务栏上就会出现一个对应的任务按钮，在一个时刻只有一个应用程序处于当前应用程序，其窗口处于最前面，标题栏高亮显示。如果需要切换当前应用程序，可以单击任务栏中对应的图标按钮，也可以按住Alt键不放，不断按Tab键，选中之后释放按钮，可在任务栏中不同的任务窗口之间进行切换操作。
应用软件（如办公软件Office、聊天工具QQ等）并不包含在Windows操作系统内，要使用它们必须先进行安装。如果安装文件是在光盘上，首先将光盘放入光驱，一般会有程序安装向导，按照提示进行安装即可；如果安装程序是从网络下载的，双击软件所在文件夹中的“Setup”或“Install”程序（后缀名为.exe）进行安装。为了安全，从网络上下载安装程序时要确保该程序的发布者及提供程序的网站是值得信任的，并在安装之前使用杀毒软件对安装文件进行扫描。
应用程序不再需要的时候可以从系统中进行卸载，以节省系统资源。在Windows7中，卸载软件可以在“控制面板”窗口中选择“程序”的“卸载程序”选项。选定要卸载的程序名称，选择“卸载”命令，在弹出的卸载确认框中单击“是”按钮，根据系统提示完成程序的卸载。
在Windows中删除应用程序时，不能只删除应用程序的文件夹或快捷方式，因为许多程序安装时会在操作系统的文件夹中加入程序的连接文件，不使用正确的删除方法将会导致删除不彻底。